长江大学学校办公室是学校党委和行政的综合办事机构，2008年7月由原党委办公室和校长办公室合并组建。学校办公室主要职能是围绕学校中心工作，积极发挥学校领导班子的参谋助手、学校的信息枢纽、部门的综合协调、工作的督促落实等作用，服务领导、服务部门、服务基层，做好调查研究、组织协调、督促检查、公文处理、信息沟通、信访接待、机要保密、印信管理、对外联络、重要活动组织、综合管理服务和校领导交办的其他工作。